波士顿和整个新英格兰地区一样，属于大陆性气候。但是由于濒临大西洋的地理位置，气候也明显受到海洋的影响。波士顿的气候变化迅速，气温突然连续几天升到华氏85度以上并不罕见。夏季炎热潮湿，而冬季寒冷，多风并且多雪。甚至在5月和10月也降过雪，当然这极为罕见。

　　波士顿的春天可能变得很热，气温升到华氏90度；但也可能到5月下旬还很寒冷，只有华氏40度，由于寒冷的海水。最热的月份在7月，平均气温为27.7摄氏度，最低气温为18.4摄氏度，通常很潮湿。最冷的月份是1月，平均气温为35.8华氏度（2.1摄氏度），最低气温为21.6华氏度（-5.6摄氏度）。夏季气温超过90华氏度，冬季气温低于10华氏度并不罕见，但很少会持续多日。记录的最高气温是104华氏度（40摄氏度）1911年, 7月4日。有记录的最低气温是 -18华氏度（-28摄氏度），1934年2月9日。

　　该市年平均降雨量为42英寸（108毫米），平均降雪正好也是42英寸（108厘米），远高于远离该市的内陆地区。马萨诸塞伸入北大西洋的地理位置也使它极易受东北风影响，一次暴风雪就可能降雪超过20英寸（50厘米）。雾极为常见，特别在春季和初夏。热带风暴或飓风偶尔也会袭击该地区，特别是在初秋。