早在1822年就开始有人在贝城（Baytown）地区定居。它最早的居民之一就是纳撒尼尔·林奇（Nathaniel Lynch）。林奇在圣加辛托河（San Jacinto River）与布法罗海湾（Buffalo Bayou）的交汇处建立了一个渡口。直到如今，这个渡口仍在运行当中，并被称为林奇堡渡口（Lynchburg Ferry）。其他最早定居在此的居民还包括威廉·斯科特（William Scott）。他是史蒂芬·富勒·奥斯汀（Stephen F. Austin）所成立的三百人企业之一。还有亚识别·斯密斯（Ashbel Smith），他在此地拥有一座农场。

　　如今的贝城是由三个社区合并而成。一个是古斯克里克（Goose Creek），与加拿大雁冬眠的海湾有着同样的名字。这一名字如今仍然在建立于1850之前的古斯克里克校区出现。随着古斯克里克油田（Goose Creek Oil Field）的发现，他它的对手，也就是建立于1910年代的佩里(Pelly)社区以及建立于1920年代的东贝城(East Baytown)，发展成为早期的新兴都市。由于东贝城其实是在古斯克里克西边，所以后来直接就被叫做贝城。

　　这三个社区的合并被正式提出是在一战后不久，而当时贝城社区对这一做法持反对意见。不过到了1947年，这三个城市最后终于同意联盟。居民们将这个新合成的城市就定名为贝城。，如今，贝城建立的官方日期被定为1948年1月24日。

　　1916年，由德州州长Ross S. Sterling和他的同伴共同建立的汉贝尔石油与炼油公司（Humble Oil and Refining Company），在此开发起古斯克里克油田。并且建立起德州第一、美国第二的近海钻井作业。这家公司后来又建立了日后将成为美国最大埃克森美孚炼油厂之一的贝城炼油厂（Baytown Refinery）。从那时开始，陆续有很其它的炼油厂在此地建立起来。如今，埃克森美孚仍然是这个城市最主要的企业之一，并且在此地经营十多家工厂。

　　1930年代，随着附近油田的开发，贝城以及这个三联市的人口急剧增加。许多外来人口来此定居。其中，一些犹太家庭还在此建立了犹太教堂会。

　　1970年代，当美国钢铁在城市附近建立德州作坊是，钢铁制造业开始在此兴起。运用于阿拉斯加石油输油管的48英尺长焊接管就是由这里的钢管厂所生产。1986年，由于经济不景气以及1980年代美国钢铁业的败落，钢管厂正式关闭。后来由金达莱钢铁公司收购，如今由美国金德勒西南钢铁公司经营。