杰弗逊从26岁成为弗吉尼亚议员的时候．就是一个激进的革命派，他坚决主张美洲新大陆与英国脱离，坚决主张建立一个自由、平等、天赋人权的美国，他为之奋斗了一生，赢得了美国人民的崇敬。但是，他的理想国度里没有有色人种。他赞成给黑人以自由，只是这个黑人的国家只能在非洲，而不是在美国。杰佛逊一生中曾拥有逾650名奴隶。1801年，在总统大选过后，波士顿的报纸讥讽他“骑在奴隶背上进入自由之殿堂”。
    具有讽刺意味的是，杰佛逊在世时便争议不断的一个题材是，他是否为其女奴海明斯子女之父？此一说法自1802年起广泛得到公众关注。一张当年的报纸上曾经登载了一张漫画：画上一只大公鸡显然是杰佛逊的模样，旁边一只母鸡充满崇敬仰望着他，母鸡头上围着三角巾，有一张黑人妇女的脸，文字说明是：“一只哲学大公鸡。”杰佛逊未曾对此作任何公开回应，但其遗嘱中要求予海明斯之两子，艾斯顿与麦迪逊自由之身。两人后来声称杰佛逊为其生父。
    按当时美国的法律，白人是绝对不能与黑人通婚的。美国许多南方庄园主都与自家漂亮的黑女奴剪不断，理还乱，身为总统的托马斯杰弗逊也未能摆脱这样的羁绊。据说，托马斯还不到40岁，妻子就故去。他实践了对亡妻的承诺，终生再未婚娶。此后，杰弗逊与海明斯的情缘长达三十年，但是，他至死没有给海明斯自由。
    从1619年第一艘奴隶船驶入美国到“废奴运动”，从通婚权利都没有的奴隶到奥巴马成功当选美国新一届总统。杰弗逊九泉之下该是涕泗横流。