长木医学区是波士顿地区医疗与研究设施的集中地,包括
贝斯以色列女执事医疗中心、
布莱根妇女医院、
波士顿儿童医院、达纳-法伯癌症研究所、哈佛医学院。贝斯以色列医疗中心和布莱根妇女医院都经历过合并:前者由贝斯以色列医院和新英格兰女执事医院合并而成,后者由彼得·本特·布莱根医院和波士顿妇女医院合并而成。马萨诸塞州总医院(MGH)靠近灯塔山,附近还有马萨诸塞州眼耳医院和斯保定康复医院。波士顿还有VA医学中心。波士顿的许多医疗设施都与大学有关。长木医学区和马萨诸塞州总医院是世界知名的医学研究中心,与哈佛医学院有关。新英格兰医学中心位于唐人街南部,与塔夫脱大学有关。波士顿医学中心位于南区,主要是波士顿大学医学院的教学医院,也是波士顿地区最大的外伤中心;它是由波士顿大学医院和波士顿市立医院合并而成。