华人促进会还发起募捐，在《纽约时报》上刊载了整版的广告，标题是“李文和与核政治迫害：因系华人而被指控”。内文写道：“为什么李文和博士至今仍然在受牢狱之苦？他并没有被指控犯有间谍罪。初期透露出来的消息恰恰相反，联调局排除了李博士把核弹信息泄露给外国政府的嫌疑……不是由于国际阴谋，而是由于国内政治，李博士深陷于种族脸谱化和种族取人的经典政治迫害之中，面临着终身监禁。在去年的国会中，再度被煽起的20世纪50年代的核疯狂，使李博士成了替罪羊，因为他是华裔，而且仅此而已。”
　　舆论也开始渐渐倒向李文和一方。李文和在洛斯阿拉莫斯国家实验室的同事、著名核武器专家里克特博士站出来作证，李文和所下载的“秘密”至少有百分九十九并非涉密文件，而是已经作为公开文献发表的资料。美国三个最有名的科学学术团体——美国科学院、美国工程学院和美国医学院也开始公开批评控方，称李文和已经成了不公正待遇的受害者，这一案件“使美国司法体制丢人现眼。”
　　2000年8月30日，负责审理李文和案的帕克法官作出了同意保释李文和的裁定，理由是需要李文和与律师一起查找与辩护有关的证据。然而公诉方向第十巡回上诉法院提起上诉，声称释放李文和将会给国家安全带来无法挽回的危害。与此同时，公诉方和辩护律师开始就辩诉交易开始进行磋商——原来指控李文和犯有59条罪状、打算判他终身监禁的公诉方此时已经乱了阵脚，主动提出了辩护交易条件：如果李文和承认59项指控中的一项“非经批准获取并控制与国防有关的文件和文字材料”罪，那么公诉方愿意撤销其余58项指控。这一辩护交易很快于2000年9月13日达成并生效。
　　法庭上，帕克法官在宣布结案之后，用深沉而权威的声音对李文和道歉：“我认为你审前被羁押在圣菲县拘留中心，受到了莫大的屈辱和全无必要的惩罚，蒙受了极大的不白之冤……虽然执法部门对你进行了指控，但是根据法律你还是清白的……去年12月或者在对你进行审讯之前的任何时候，都没有必要将你羁押……李博士，对于执法部门在你被羁押期间对你的不公正待遇，我真心实意地向你道歉。”接着他宣布休庭。李文和侧过身问霍尔舍律师：“法官是不是通常都这样说话？”“不，文和，这非常罕见。”霍尔舍律师眼中含着泪答道。
　　然而，这并不意味着正义已经得到实现。李文和仍然被判定为有罪，这项罪责只给他带来9个月的刑期。虽然由于他此前已经被关押278天，超过了刑期而获得当庭释放，然而这两年多的折磨与不公，仍然给李文和与他的家人带来了重大的伤害。用他自己的话说：“我的美国梦幻灭了。”
　　明白这一点之后，李文和开始了洗刷罪名的奔波。他开始起诉美国联邦政府和5家媒体，指控他们非法侵犯了他的隐私，破坏了他的生活，并且对他施加了不公的对待。这些艰难的诉讼，获得了积极的结果。2006年6月3日，美国联邦政府和5家媒体组织(华盛顿邮报、洛杉矶时报、纽约时报、美国广播公司和美联社)宣布他们会一起向李文和支付160万美元。然而这项象征性的赔款是否足以抚平他心中的不公与伤痛呢？恐怕只有李文和自己才能说清。